MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Borrelia valaisiana VS116 plasmid VS116_cp9

Total Repeats: 70

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012130	TACTT	2	10	1	10	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_012130	ACA	2	6	37	42	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_012130	A	6	6	63	68	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_012130	A	9	9	82	90	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_012130	TAAT	2	8	2583	2590	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_012130	TAAA	2	8	2593	2600	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_012130	A	7	7	2604	2610	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_012130	AATAT	2	10	3225	3234	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_012130	TAT	2	6	3274	3279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_012130	A	7	7	3339	3345	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_012130	ATT	2	6	3362	3367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_012130	TAA	2	6	3371	3376	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_012130	T	8	8	3380	3387	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_012130	T	6	6	3391	3396	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_012130	A	6	6	3410	3415	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_012130	A	6	6	3423	3428	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_012130	TA	4	8	3447	3454	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_012130	ATT	2	6	4469	4474	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_012130	AT	3	6	4475	4480	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_012130	ATA	2	6	4501	4506	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_012130	A	7	7	4881	4887	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_012130	ATTTTT	2	12	4900	4911	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_012130	T	9	9	4907	4915	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_012130	TCT	2	6	4946	4951	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_012130	CTAT	2	8	4988	4995	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_012130	T	6	6	5053	5058	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_012130	AT	3	6	5071	5076	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_012130	ATT	2	6	5099	5104	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_012130	TA	3	6	5106	5111	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_012130	TATT	2	8	5131	5138	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_012130	CT	3	6	5782	5787	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_012130	AT	3	6	5813	5818	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_012130	T	7	7	5831	5837	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_012130	AAT	2	6	5854	5859	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_012130	T	6	6	5902	5907	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_012130	A	6	6	5916	5921	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_012130	TTA	2	6	5928	5933	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_012130	T	6	6	6198	6203	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_012130	TTA	2	6	6235	6240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_012130	A	8	8	6300	6307	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_012130	TAAA	2	8	6357	6364	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_012130	GAA	2	6	6383	6388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_012130	ATTA	2	8	6442	6449	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_012130	TAA	2	6	6519	6524	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_012130	TAA	2	6	6560	6565	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_012130	T	6	6	6612	6617	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_012130	TAAT	2	8	6650	6657	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_012130	TTA	2	6	6666	6671	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_012130	ATT	2	6	6686	6691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_012130	CAA	2	6	6709	6714	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_012130	A	6	6	6713	6718	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_012130	TATC	2	8	6771	6778	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_012130	AT	3	6	6795	6800	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_012130	AT	3	6	6808	6813	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_012130	T	6	6	6893	6898	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_012130	TTA	2	6	6901	6906	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_012130	T	6	6	6944	6949	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_012130	ATT	2	6	7009	7014	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_012130	TTTG	2	8	7032	7039	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_012130	ATG	2	6	7866	7871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_012130	CCA	2	6	8999	9004	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_012130	TA	4	8	9289	9296	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_012130	T	7	7	9315	9321	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_012130	T	6	6	9327	9332	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_012130	A	8	8	9335	9342	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_012130	T	7	7	9343	9349	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_012130	TTA	2	6	9406	9411	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_012130	AAT	2	6	9433	9438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_012130	ATC	2	6	9444	9449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_012130	ACT	2	6	9462	9467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.